近日,世界首款大麦高密度液相单核苷酸多态性芯片在西北农林科技大学研发成功,这是基于我国青藏高原特有的裸大麦也就是青稞研发的世界首款大麦液态芯片。这款新型芯片突破了以往全球大麦芯片缺乏我国种质资源基因组信息的瓶颈,储存了40519个大麦遗传信息,为选育优良大麦品种提供了强力支撑。
目前市场上的用于理论和育种研究的大麦芯片产自欧美,并且多是传统的固相芯片,在使用成本、通量、灵活性等方面都不如新一代液相芯片。同时这些芯片不包含野生材料基因组信息,也没有我国大麦尤其是青稞的基因组信息,在覆盖基因组的深度和广度不如新一代大麦液相芯片。
来自西北农林科技大学的宋卫宁教授团队基于对来自全球不同生态区、不同类型的155份大麦材料的全基因组数据,从海量单核苷酸多态性数据集中挑选了代表性强、多态性高的位点信息,整合已鉴定的数百个重要性状相关位点信息,成功开发了世界首款大麦高密度液相芯片。
大麦是全球位居第四的重要禾本科作物,能够在干旱、盐碱等严酷环境中种植。除了人畜食用外,还是食品和饮料工业广泛使用的重要原料。在我国青藏高原,青稞也就是裸大麦具有极其重要经济和文化价值。我国的大麦育种急需这样精准高效的芯片利器,农为国本,种为农先,新型大麦芯片在大麦分子育种、设计育种和理论研究方面具有广阔的应用前景,目前该项研究已申请专利(总台央视记者 闫星光 孟涛 )
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